据文献资料报道盐酸帕罗西汀临床对照研究观察到的主要不良反应为中枢神经系统：嗜睡、失眠、激动、震颤、焦虑、头晕；胃肠道系统包括便秘、恶心、腹泻、口干、呕吐和胃肠胀气；其他还有乏力、性功能障碍(包括阳痿、性欲下降)。
多数不良反应的强度和频率随时用药的时间而降低，通常不影响治疗。
曾有不安、幻觉、轻躁狂、红-绿色盲、呕吐及血清素综合症的报道。
与其它5-羟色胺再摄取抑制剂一样，有报道服用本品造成短暂的血压改变，此情况多发生于有潜
在高血压或焦虑患者，但少有心动过速的报道。曾有发生意识障碍的报道。也有报道肝功能异常，但
少有严重的肝功能异常，若肝功能检查持续升高应考虑停服本品。还有报道异常出血(多为瘀血和紫癜)，
也有血小板减少症的少量报道。很少有惊厥、躁狂、急性青光眼、尿潴留及外周水肿的报道，偶有报道
光敏反应、皮疹(包括伴有瘙痒或血管神经水肿的荨麻疹)，Neroleptic malignant综合症(通常发生在
合用或最近停用精神安定类药的患者)。低钠血症者较少见，主要发生在老年人，通常在停药后迅速恢复。
也有疑为高催乳素血症/溢乳症的症状报道。
本品较三环类抗抑郁药所引起的不良反应如：口干、便秘、和嗜睡少见。锥体外系反应包括口-面部
肌张力障碍罕见报道，大多发生有潜在运动障碍的病人或正服用精神科类药物者。
也有报道迅速停药而引起的综合症状(如头晕、感觉障碍、睡眠障碍、激动、震颤、恶心、出汗恐怖
症/社交焦虑症、意识模糊)。建议终止治疗前逐渐减量。
