1）常见消化道紊乱（恶心、胃痛），多出现在治疗开始时，但是不需停止治疗，症状通常可在数天内消失。
（2）肝功能异常
发生时情况：极个别有报导严重肝损害甚至死亡，最高危的病人（特别是接受多种抗癫痫药治疗）是有严重癫痫发作的婴儿和3岁以下的儿童，尤其是那些伴有脑损害，精神发育迟缓和/或遗传代谢或退化性疾病，3岁以后，危险性明显下降、并随年龄增长而进一步下降，在大多数病例，肝损害在治疗头六个月里出现。
可疑症状：临床症状是早期诊断的依据，特别是黄疸出现之前，出现下列症状应考虑到肝损害的可能，特别是那些高危病人。
a．非特异性症状，通常突然出现，如乏力、厌食、嗜睡、思睡，有时伴有反复呕吐和腹痛。
b．癫痫复发：应告诫病人（或患儿家属），当有上述症状出现时，应及时报告医生，并立即进行临床检查及肝功能检查。观察：在治疗前应进行肝功能检查，在治疗头6个月内也应定期作肝功能检查，特别是高危病人，在一般检查中，反映蛋白合成的试验，特别是凝血酶原率最为相关。当确定在异常的低凝血酶原率，特别是伴有其它生化异常（纤维蛋白原和凝血因子明显减低，胆红素增加和转氨酶升高）需要停止治疗，作为预防措施，如病人同时应用水杨酸盐也应信用，因为这些药物的代谢途径是相同的。
（3）神经功能紊乱，在丙戊酸类药物治疗期间，少数患者出现嗜睡或木僵，并导致一过性昏迷（脑病），当治疗时，可单独出现或与癫痫发作同时出现，当剂量减少或停用时，这些症状会减少，这些病例常发现在联合治疗特别是用苯巴比妥或突然增加丙戊酸剂量之后。
（4）短暂的和/或与剂量相关的不良反应已有报导：脱发、轻度姿势性震颤和嗜睡。
（5）已有报导单纯性纤维蛋白原减少或出血时间延长，通常不伴有临床体征，此多发生于大剂量时（丙戊酸对血小板聚集第二期有抑制作用）
（6）血液系统：多为血小板减少，罕有贫血，白细胞减少或全血细胞减少。
（7）偶有报导胰腺炎，有时导致死亡。
（8）有报告血管炎
（9）无肝功能异常的单纯和轻度高氨血症时有出现，但不需要停止治疗。
（10）也报告体重增加，闭经及月经紊乱。
（11）偶有报导可逆或不可逆的听力丧失，但某因果关系尚未明确。
（12）丙戊酸可引起皮肤反应，如皮疹。在某些病例有毒性上皮坏死溶解，Stevens-Johnson综合症，多形性红斑也有报导。
（13）有单独报导，伴随丙戊酸治疗出现可逆性Fanconi氏综合症，但其作用机理未明。
